STUDI MOLEKULER POTENSI SENYAWA PADA DAUN Clinacanthus nutans SEBAGAI ANTIPROLIFERASI KANKER PAYUDARA MENGGUNAKAN PENDEKATAN BIOINFORMATIKA

RAMADHANI, FAIRUZ AFIFAH and Syarif, Nirwan and Shiyan, Shaum (2020) STUDI MOLEKULER POTENSI SENYAWA PADA DAUN Clinacanthus nutans SEBAGAI ANTIPROLIFERASI KANKER PAYUDARA MENGGUNAKAN PENDEKATAN BIOINFORMATIKA. Undergraduate thesis, Sriwijaya University.

	Text RAMA_48201_08061282025061.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (6MB) | Request a copy
	Text RAMA_48201_08061282025061_TURNITIN.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (10MB) | Request a copy
	Text RAMA_48201_08061282025061_0001107001_0028058601_01_front_ref.pdf - Accepted Version Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (515kB)
	Text RAMA_48201_08061282025061_0001107001_0028058601_02.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (1MB) | Request a copy
	Text RAMA_48201_08061282025061_0001107001_0028058601_03.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (124kB) | Request a copy
	Text RAMA_48201_08061282025061_0001107001_0028058601_04.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (1MB) | Request a copy
	Text RAMA_48201_08061282025061_0001107001_0028058601_05.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (8kB) | Request a copy
	Text RAMA_48201_08061282025061_0001107001_0028058601_06_ref.pdf - Bibliography Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (121kB) | Request a copy
	Text RAMA_48201_08061282025061_0001107001_0028058601_07_lamp.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (3MB) | Request a copy

Abstract

Kanker payudara adalah kelainan pada payudara yang berupa tumor karena proliferasi sel. Penelitian ini bertujuan memprediksi potensi molekuler dari senyawa daun Clinacanthus nutans terhadap aktivitas antiproliferasi kanker payudara dengan pendekatan bioinformatika. Ekstrak yang memiliki senyawa potensi ditelaah interaksi molekulernya. Basis data pkCSM menampilkan profil ADMET tiap senyawa. Basis data SwissADME menampilkan hasil analisis druglikeness tiap senyawa memenuhi aturan Lipinski. Basis data GeneCards mengidentifikasi gen proliferasi kanker payudara dan basis data SwissTargetPrediction mengidentifikasi gen protein target senyawa, gen target yang saling berpotongan diketahui lewat FunRich. STRING dan Cytoscape membangun jejaring interaksi protein-protein dan prediksi top 10 gen hub bedasarkan nilai degree. ClueGO menganalisis GO/KEGG enrichment, didapat target dengan jalur utama kanker payudara, yaitu EGFR, ESR1, ERBB2, dan PGR. Preparasi dan skrining virtual reseptor dan ligan menggunakan Pymol dan Pyrx. Docking divalidasi secara internal dengan ligan asli dan eksternal dengan ligan obat dari basis data TTD. Hasil yang dipilih adalah binding affinity terendah dan RMSD <2Å. Docking ligan uji dengan reseptor dijalankan dengan protokol docking seperti validasi. Visualisasi dan evaluasi hasil terbaik bedasarkan nilai RMSD, binding affinity, dan interaksi asam amino. Senyawa paling berpotensi adalah Dehydrovomifoliol dan Curdione, yang memiliki RMSD 0, berinteraksi dengan asam amino pada binding pocket, dan binding affinity mendekati hasil pada validasi dengan binding affinity terbaik pada kompleks Curdione-ESR1 yaitu -7,3 kcal/mol. Visualisasi binding pocket kompleks reseptor-ligan dilakukan untuk melihat kemampuan ligan uji sebagai inhibitordan gugus farmakofornya.

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Subjects:	R Medicine > RS Pharmacy and materia medica > RS160-167 Pharmacognosy. Pharmaceutical substances (Plant, animal, and inorganic)
Divisions:	08-Faculty of Mathematics and Natural Science > 48201-Pharmacy (S1)
Depositing User:	Fairuz Afifah Ramadhani
Date Deposited:	25 Jan 2024 05:43
Last Modified:	25 Jan 2024 05:43
URI:	http://repository.unsri.ac.id/id/eprint/139468

Actions (login required)

View Item