DNA BARCODE IKAN SUMATRA (Puntius tetrazona) BERDASARKAN GEN SITOKROM C OKSIDASE SUBUNIT I (COI)

ROSSANTY, ELYDIA and Syaifudin, Mochamad (2022) DNA BARCODE IKAN SUMATRA (Puntius tetrazona) BERDASARKAN GEN SITOKROM C OKSIDASE SUBUNIT I (COI). Undergraduate thesis, Sriwijaya University.

	Text RAMA_54243_05051281823024.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (2MB) | Request a copy
	Text RAMA_54243_05051281823024_TURNITIN.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (4MB) | Request a copy
Preview	Text RAMA_54243_05051281823024_0003037602_01_front_ref.pdf - Accepted Version Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (1MB) | Preview
	Text RAMA_54243_05051281823024_0003037602_02.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (276kB) | Request a copy
	Text RAMA_54243_05051281823024_0003037602_03.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (536kB) | Request a copy
	Text RAMA_54243_05051281823024_0003037602_04.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (713kB) | Request a copy
	Text RAMA_54243_05051281823024_0003037602_05.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (184kB) | Request a copy
	Text RAMA_54243_05051281823024_0003037602_06_ref.pdf - Bibliography Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (344kB) | Request a copy
	Text RAMA_54243_05051281823024_0003037602_07_lamp.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (1MB) | Request a copy

Abstract

Ikan sumatra (Puntius tetrazona) merupakan salah satu jenis ikan hias air tawar endemik yang tersebar di Pulau Sumatera dan Kalimantan. Ikan ini memiliki beberapa varietas diantaranya tiger barb, green tiger barb, albino tiger barb dan balloon tiger barb. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui sekuen gen COI DNA mitokondria dan konstruksi filogenetik. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Oktober-Desember 2021. Metode yang digunakan dalam barcoding DNA spesies ikan sumatra yaitu ekstraksi DNA, amplifikasi DNA menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR), elektroforesis dan sekuensing daerah gen COI pada mtDNA. Sampel ikan didapatkan dari Sungai Lematang, Sungai Musi dan dari budidaya komersil di Palembang. Fragmen gen COI mtDNA yang telah disekuensing didapatkan hasil PCR dengan optimasi suhu annealing 52℃ selama 45 detik dalam 32 siklus (sampel dari Sungai Lematang) dan 51℃ selama 30 detik dalam 35 siklus (sampel dari Sungai Musi dan dari budidaya komersil). Sekuensing gen COI menghasilkan panjang nukleotida 645 base pairs (bp). Hasil analisis BLASTn sampel ikan sumatra asal Sungai Lematang dan Sungai Musi memiliki kemiripan tertinggi sebesar 93,00%-93,30% dengan spesies P. tetrazona sementara sampel asal budidaya komersil Palembang memiliki kemiripan tertinggi sebesar 97,34%-97,60% dengan spesies yang sama pada data Genbank. Filogenetik dua populasi ikan sumatra asal Sungai Lematang dan Sungai Musi terhadap budidaya komersil Palembang membentuk dua subcluster yang terpisah. Kata kunci: Filogenetik, Gen sitokrom C oksidase subunit I, Ikan sumatra

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Uncontrolled Keywords:	Filogenetik, Gen sitokrom C oksidase subunit I, Ikan sumatra
Subjects:	S Agriculture > SH Aquaculture. Fisheries. Angling > SH1-691 Aquaculture. Fisheries. Angling S Agriculture > SH Aquaculture. Fisheries. Angling > SH327.5-327.7 Fishery resources. Fishery conservation
Divisions:	05-Faculty of Agriculture > 54243-Aquaculture (S1)
Depositing User:	Elydia Rossanty
Date Deposited:	05 Aug 2022 03:08
Last Modified:	05 Aug 2022 03:08
URI:	http://repository.unsri.ac.id/id/eprint/76316

Actions (login required)

View Item