DNA BARCODE IKAN SENGGIRINGAN (Desmopuntius sp.) BERDASARKAN GEN SITOKROM C OKSIDASE SUBUNIT I (COI)

SEPTIANA, DWI RIZKI and Syaifudin, Mochamad and Jubaedah, Dade (2022) DNA BARCODE IKAN SENGGIRINGAN (Desmopuntius sp.) BERDASARKAN GEN SITOKROM C OKSIDASE SUBUNIT I (COI). Undergraduate thesis, Sriwijaya University.

	Text RAMA_54243_05051181823014.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (1MB) | Request a copy
	Text RAMA_54243_05051181823014_TURNITIN.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (4MB) | Request a copy
Preview	Text RAMA_54243_05051181823014_0003037602_0021077701_01_front_ref.pdf - Accepted Version Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (526kB) | Preview
	Text RAMA_54243_05051181823014_0003037602_0021077701_02.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (87kB) | Request a copy
	Text RAMA_54243_05051181823014_0003037602_0021077701_03.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (233kB) | Request a copy
	Text RAMA_54243_05051181823014_0003037602_0021077701_04.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (205kB) | Request a copy
	Text RAMA_54243_05051181823014_0003037602_0021077701_05.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (31kB) | Request a copy
	Text RAMA_54243_05051181823014_0003037602_0021077701_06_ref.pdf - Bibliography Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (48kB) | Request a copy
	Text RAMA_54243_05051181823014_0003037602_0021077701_07_lamp.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (908kB) | Request a copy

Abstract

Ikan senggiringan (Desmopuntius sp.) merupakan salah satu sumber daya perikanan air tawar yang tersebar luas di Sumatera. Penangkapan yang berlebihan, penggunaan alat tangkap yang tidak selektif, serta adanya pencemaran perairan dikhawatirkan dapat mengakibatkan berkurangnya jumlah populasi ikan senggiringan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendapatkan sekuen gen sitokrom C oksidase subunit I (COI) mitokondria DNA, mengetahui persentase identitas dan pohon filogenetik antar spesies ikan senggiringan serta mengetahui sifat fisika kimia perairan habitat hidup ikan senggiringan di Sungai Lematang dan Sungai Ogan di Sumatera Selatan. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Oktober 2021-Januari 2022. Metode yang digunakan dalam barcoding adalah dengan melakukan isolasi DNA, elektroforesis, amplifikasi menggunakan PCR (Polymerase Chain Reaction), sekuensing daerah gen COI pada mtDNA dan pohon filogenetik dikonstruksi menggunakan metode Neighbor Joining (NJ) serta pengukuran kualitas air dari habitat ikan senggiringan. Fragmen gen COI mtDNA yang telah disekuensing didapatkan hasil PCR dengan optimasi suhu annealing 50,4ºC selama 30 detik. Sekuensing gen COI menghasilkan panjang nukleotida 681 base pairs (bp). Hasil analisis BLASTn sampel ikan senggiringan asal Sungai Lematang dan Sungai Ogan memiliki kemiripan tertinggi dengan Desmopuntius gemellus asal Sumatera dan Kalimantan sebesar 99,33% (Sungai Lematang) dan 99,50% (Sungai Ogan). Filogenetik ikan senggiringan asal Sungai Lematang dan Sungai Ogan berada dalam cluster yang sama dengan Desmopuntius gemellus. Kata kunci: Filogenetik, Gen Sitokrom C Oksidase Subunit I, Ikan Senggiringan

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Uncontrolled Keywords:	Filogenetik, Gen Sitokrom C Oksidase Subunit I, Ikan Senggiringan
Subjects:	S Agriculture > SH Aquaculture. Fisheries. Angling > SH151-179 Fish culture > SH155.6.M48 Fishes--Artificial spawning. Fishes--Germplasm resources--Cryopreservation. Shellfish--Artificial spawning.
Divisions:	05-Faculty of Agriculture > 54243-Aquaculture (S1)
Depositing User:	Dwi Rizki Septiana
Date Deposited:	15 Sep 2022 05:07
Last Modified:	15 Sep 2022 05:07
URI:	http://repository.unsri.ac.id/id/eprint/78797

Actions (login required)

View Item