KEKERABATAN GENETIK IKAN TAWES (Barbonymus gonionotus) ASAL SUNGAI OGAN DAN SUNGAI KELEKAR BERDASARKAN GEN SITOKROM C OKSIDASE SUBUNIT 1 (CO1)

MAULIA, MINATUL and Syaifudin, Mochamad (2024) KEKERABATAN GENETIK IKAN TAWES (Barbonymus gonionotus) ASAL SUNGAI OGAN DAN SUNGAI KELEKAR BERDASARKAN GEN SITOKROM C OKSIDASE SUBUNIT 1 (CO1). Undergraduate thesis, Sriwijaya University.

[thumbnail of RAMA_54243_05051282025022.pdf] Text
RAMA_54243_05051282025022.pdf - Accepted Version
Restricted to Repository staff only
Available under License Creative Commons Public Domain Dedication.

Download (1MB) | Request a copy
[thumbnail of RAMA_54243_05051282025022_TURNITIN.pdf] Text
RAMA_54243_05051282025022_TURNITIN.pdf - Accepted Version
Restricted to Repository staff only
Available under License Creative Commons Public Domain Dedication.

Download (5MB) | Request a copy
[thumbnail of RAMA_54243_05051282025022_0003037602_01_Front_ref.pdf] Text
RAMA_54243_05051282025022_0003037602_01_Front_ref.pdf - Accepted Version
Available under License Creative Commons Public Domain Dedication.

Download (865kB)
[thumbnail of RAMA_54243_05051282025022_0003037602_02.pdf] Text
RAMA_54243_05051282025022_0003037602_02.pdf - Accepted Version
Restricted to Repository staff only
Available under License Creative Commons Public Domain Dedication.

Download (237kB) | Request a copy
[thumbnail of RAMA_54243_05051282025022_0003037602_03.pdf] Text
RAMA_54243_05051282025022_0003037602_03.pdf - Accepted Version
Restricted to Repository staff only
Available under License Creative Commons Public Domain Dedication.

Download (432kB) | Request a copy
[thumbnail of RAMA_54243_05051282025022_0003037602_04.pdf] Text
RAMA_54243_05051282025022_0003037602_04.pdf - Accepted Version
Restricted to Repository staff only
Available under License Creative Commons Public Domain Dedication.

Download (317kB) | Request a copy
[thumbnail of RAMA_54243_05051282025022_0003037602_05.pdf] Text
RAMA_54243_05051282025022_0003037602_05.pdf - Accepted Version
Restricted to Repository staff only
Available under License Creative Commons Public Domain Dedication.

Download (141kB) | Request a copy
[thumbnail of RAMA_54243_05051282025022_0003037602_06_ref.pdf] Text
RAMA_54243_05051282025022_0003037602_06_ref.pdf - Bibliography
Restricted to Repository staff only
Available under License Creative Commons Public Domain Dedication.

Download (212kB) | Request a copy
[thumbnail of RAMA_54243_05051282025022_0003037602_07_lamp.pdf] Text
RAMA_54243_05051282025022_0003037602_07_lamp.pdf - Bibliography
Restricted to Repository staff only
Available under License Creative Commons Public Domain Dedication.

Download (372kB) | Request a copy

Abstract

Genus barbonymus memiliki empat spesies yang tersebar di perairan Pulau Jawa, Kalimantan, dan Sumatera. Salah satunya adalah ikan tawes yang dikenal dengan nama bader putihan, Barbonymus gonionotus. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui sekuen gen sitokrom C oksidase subunit 1 DNA mitokondria ikan tawes, mengetahui jarak genetik, filogenetik antar spesies ikan tawes dan kualitas air asal Sungai Ogan dan Sungai Kelekar. Penelitian ini telah dilaksanakan pada bulan Oktober 2023-Februari 2024. Metode yang digunakan dalam barcoding spesies ikan tawes yaitu isolasi DNA, amplifikasi DNA menggunakan PCR (Polymerase Chain Reaction), elektroforesis dan sekuensing daerah gen CO1 pada mtDNA. Fragmen gen COI mtDNA yang telah disekuensing didapatkan dari hasil PCR dengan suhu annealing 50,9℃ selama 30 detik dengan 31 siklus. Panjang nukleotida gen COI yang dihasilkan pada ikan tawes asal Sungai Ogan dan asal Sungai Kelekar berukuran 629 bp. Analisis BLASTn sampel ikan tawes asal Sungai Ogan dan Sungai Kelekar memiliki kemiripan sebesar 100% dengan spesies yang sama pada data Genbank. Filogenetik ikan tawes memiliki tiga cluster utama yaitu cluster pertama dan terdiri dari spesies Barbonymus gonionotus, cluster kedua terdiri dari spesies Hypsibarbus malcolmi, Hypsibarbus wetromei, Poropuntius opisthoptera, Poropuntius laoensis sedangkan cluster yang ketiga terdiri dari spesies outgroup yaitu Puntius tetrazona. Hasil pengukuran kualitas air dari Sungai Ogan dan Sungai Kelekar selama penelitian yaitu suhu 29,2-31,8℃, oksigen terlarut 3,4-6,9 mg L-1, TDS 0,04-0,013 mg L-1, pH 5,5-6,7, kecerahan 45-80 cm dan amonia 0,09-0,20 mg L-1.

Item Type: Thesis (Undergraduate)
Uncontrolled Keywords: gen CO1, ikan tawes, Sungai Kelekar, Sungai Ogan
Subjects: S Agriculture > SH Aquaculture. Fisheries. Angling > SH1-691 Aquaculture. Fisheries. Angling
S Agriculture > SH Aquaculture. Fisheries. Angling > SH334.5-334.7 Fishery technology
Divisions: 05-Faculty of Agriculture > 54243-Aquaculture (S1)
Depositing User: Minatul Maulia
Date Deposited: 18 Jul 2024 06:43
Last Modified: 18 Jul 2024 06:43
URI: http://repository.unsri.ac.id/id/eprint/151687

Actions (login required)

View Item View Item